Пролог: Временной сдвиг.
После финальной битвы первой части мода, где ГГ противостоял могущественному лидеру нацистского анклава в постапокалиптической Америке, происходит катастрофа. В результате активации экспериментального оружия, созданного на основе технологий Третьего Рейха и довоенных американских разработок, пространство-время разрывается. ГГ, находясь в эпицентре взрыва, оказывается выброшенным в 1943 год, в самый разгар Второй мировой войны.Герой приходит в себя на секретной базе Сопротивления, расположенной в подземных туннелях под крепостью Вольфенштайн. База находится в осаде, а нацисты, используя передовые технологии (которые, как позже выяснится, были разработаны с помощью знаний из будущего), почти полностью подавили сопротивление.
Акт I: Враги прошлого и будущего.
ГГ знакомится с лидерами Сопротивления, среди которых оказываются знакомые по вселенной Wolfenstein персонажи, такие как Бласкович и Анна Олива. Они с подозрением относятся к странному незнакомцу, но быстро понимают, что он обладает уникальными знаниями и навыками из будущего. ГГ рассказывает о том, что нацисты в его времени почти победили мир, и их технологии стали ещё более опасными.
Вскоре выясняется, что нацисты уже знают о временном сдвиге. Их учёные, вдохновлённые чертежами из будущего, ускорили разработку оружия и роботов. ГГ понимает, что его появление в прошлом может быть частью плана нацистов по изменению истории в свою пользу.
Акт II: Битва за время.
ГГ и Сопротивление начинают серию диверсий против нацистов, чтобы остановить их планы. В ходе миссий ГГ сталкивается с усовершенствованными версиями врагов из Fallout — роботами, мутантами и солдатами в силовой броне, которую нацисты создали с помощью технологий из будущего. Также герой узнаёт, что в крепости Вольфенштайн находится временной портал, который нацисты пытаются стабилизировать, чтобы вызвать подкрепления из будущего.
ГГ приходится балансировать между помощью Сопротивлению и поиском способа вернуться в своё время. Однако он понимает, что если нацисты добьются успеха, то будущее, из которого он прибыл, станет ещё более мрачным.
Акт III: Крепость Вольфенштайн.
Финальная часть сюжета приводит ГГ и отряд Сопротивления к штурму крепости Вольфенштайн. Внутри крепости их ждут мощные враги, включая экспериментальных суперсолдат и роботов-охранников. ГГ сталкивается с лидером нацистского проекта — учёным, который знает о будущем и планирует использовать временной портал, чтобы обеспечить победу Третьего Рейха во всех временных линиях.
В эпической финальной битве ГГ и Сопротивление уничтожают портал, но это приводит к новому временному сдвигу. ГГ оказывается в альтернативной версии постапокалиптического мира, где нацисты всё же добились технологического превосходства, и теперь ему предстоит продолжить борьбу в этом новом, ещё более опасном мире.
Особенности геймплея.
Смешение технологий: ГГ может использовать как оружие и технологии из Fallout (лазерные винтовки, силовую броню), так и довоенные образцы (винтовки, пистолеты, взрывчатку).
Выбор и последствия: Игрок может принимать решения, которые влияют на исход войны. Например, помочь Сопротивлению уничтожить нацистов или попытаться вернуться в своё время, рискуя оставить прошлое без защиты.
Новые враги: Нацистские роботы, мутанты и суперсолдаты, созданные с использованием технологий из будущего.
Временные парадоксы: ГГ может находить записи и артефакты, которые намекают на его собственное влияние на историю.
