Основная идея.
Главный герой Fallout 4 встречает необычного компаньона - Карлсона, чудаковатого мужчину, который утверждает, что он "живёт на крыше" и спустился вниз только потому, что закончились запасы тушёнки. Карлсон - это пародия на классического литературного персонажа, но с постапокалиптическим уклоном. Он ведёт себя как аристократ, хотя носит рваный пиджак и цилиндр, и постоянно рассказывает истории о своих "приключениях на крыше", которые звучат как бред, но иногда оказываются правдой.
Сюжетная завязка.
После ядерной войны мир Fallout изменился, но некоторые вещи остались неизменными — например, жажда власти, контроля и... насилия. В пустоши появляется загадочный персонаж, известный как офицер Джо Викерс (протагонист из фильма Psycho Cop). Он — бывший полицейский, который пережил Великую войну благодаря тому, что находился в подземном бункере, предназначенном для экспериментов с психикой. После выхода на поверхность он обнаруживает, что его внутренние демоны только усилились, и теперь он видит себя "законом" в этом хаотичном мире.
Пролог: Альтернативное Содружество.
ГГ оказывается в альтернативной версии постапокалиптического мира, где нацисты, благодаря технологиям из прошлого и будущего, захватили власть над большей частью мира. Содружество (Commonwealth) теперь находится под контролем нацистского анклава, который использует передовые технологии для подавления сопротивления. Города превращены в укреплённые крепости, а выжившие либо порабощены, либо скрываются в подполье.
ГГ понимает, что его действия в прошлом привели к этой катастрофе. Теперь ему предстоит не только вернуться в своё время, но и исправить временной парадокс, чтобы восстановить оригинальную временную линию.
Пролог: Временной сдвиг.
После финальной битвы первой части мода, где ГГ противостоял могущественному лидеру нацистского анклава в постапокалиптической Америке, происходит катастрофа. В результате активации экспериментального оружия, созданного на основе технологий Третьего Рейха и довоенных американских разработок, пространство-время разрывается. ГГ, находясь в эпицентре взрыва, оказывается выброшенным в 1943 год, в самый разгар Второй мировой войны.Герой приходит в себя на секретной базе Сопротивления, расположенной в подземных туннелях под крепостью Вольфенштайн. База находится в осаде, а нацисты, используя передовые технологии (которые, как позже выяснится, были разработаны с помощью знаний из будущего), почти полностью подавили сопротивление.